METODE PEMBELAJARAN yang diterapkan di Pesantren Virtual Bahasa Arab Al-Madinah adalah penggabungan antara web basic learning dengan perkuliahan online (teleconference) secara terjadwal. Adapun struktur pembelajaran terbagi menjadi beberapa macam kelas sebagai berikut.
| >>KELAS REGULER: | >>KELAS REGULER INTENSIF: |
| 1. Kelas Pemula A | 1. Kelas Persiapan Masuk LIPIA |
| 2. Kelas Pemula B | >>KELAS INTENSIF: |
| 3. Kelas Menengah | 1. Bahasa Arab Spesial Ramadhan |
| 4. Kelas Lanjutan | 2. Bahasa Arab Intensif Liburan |
| 5. Kelas Durusullughoh | 3. Try Out Masuk LIPIA (Offline) |
| 6. Kelas ABY | >>KELAS KHUSUS: |
| 7. Kelas Al-Uluum Asy-Syariyyah | 1. Kelas Privat Bahasa Arab |
| 2. Kelompok Belajar Bahasa Arab | |
| 3. Kelas Tahsin Al Qur’an |